从5月15日开始，上航将每天早晨上海到成都的FM9541航班全部改用波音767大型飞机，以确保抗震救灾物资承运。15日下午承运25吨地震灾区急需的发电机；5月16日，将吴孟超医学基金会等单位筹措的25吨医药用品、医疗器械、食品等物资运往绵阳，剩余的12吨运往绵阳。从13至16日上航共出动了16架次的航班，紧急承运了107.1吨抗震救灾物资。

地震发生后，通过上航假期旅行社参加旅游的202名上海游客滞留四川绵阳、成都、峨眉山、九寨等地。旅行社经过多方努力,于5月14日下午2点40分，将第一批54名游客通过加班机安全接回上海；第二批31名游客搭乘上航FM9464次航班于15日凌晨回到上海；第三批25名游客从九黄机场搭乘航班飞赴重庆，再搭乘上航航班，16日下午2点返回上海；第四批70名游客16晚上10点回到上海；最后一批22名游客，17日下午从重庆返回上海。